خانه موزه شهید مدرس شامل سه حیاط مرکزی، چندین اتاق، راهرو، حوض‌خانه و سه درب ورودی است که بخش اندرونی آن به خانواده مدرس و بخش بیرونی آن به مراجعات شیخ و میهمانان او اختصاص داشت. پس از شهادت آیت الله مدرس، خانه تخلیه شده و پس از مدتی به عنوان خانه وزیر مختار فرانسه مورد استفاده قرار می‌گیرد که البته حضور این شخصیت سیاسی چندان به درازا نکشیده و خانه به تدریج رو به ویرانی می‌رود. این روند ادامه پیدا می‌کند تا اینکه در نهایت خانه متروک شده، در سال ۱۳۹۳ توسط فردی به نام محمد انصاری خریداری و پس از مرمت، اکنون به عنوان دارالقرآن و خانه موزه شهید مدرس مورد استفاده قرار می‌گیرد.