مسجد کبود گنبد بین اقوام مختلف شهرستان کلات، مسجد محترمی بوده. به همین دلیل، کامل‌ترین هنر معماری و تزئین نقش‌ها در این بنا بکار رفته. این مسجد الان در مرکز شهر کلات قرار گرفته و بنای اون چهار ایوون، گنبد دو پوشه و نیلی رنگی، صحن و طاق داره. ساقه گنبد استوانه‌ای شکله و فضای زیر گنبد هشت ضلعی منظمی هست و طول هر ضلع اون به ۴ متر میرسه. صحن مسجد مستطیل شکلش، ۱۹ متر عرض و ۲۷ متر طول داره.
برای تزئین این مسجد از کاشی هفت رنگ استفاده شده که در اون نقش‌های اسلیمی و گل و بوته در لچکی‌های بالای ایوون و رواق‌ها به کار رفته. بنای اصلی مسجد رو از بناهای دوره سلجوقی میدونن، که نادرشاه افشار هم، خونه‌ها و ایوون‌های اطراف اون رو ساخته. اطراف پیشخوان ورودی مسجد، کتیبه‌ای سنگی و با خط نستعلیق وجود داره که مربوط به دوره قاجار هست و نشون میده تعمیر مسجد در این دوره و به دست یلنگ توش خان ابن فتحعلی، حاکم کلات و در سال ۱۲۵۰ هجری قمری انجام گرفته.