مسجد حاج صفر علی توسط حاج صفر‌علی خویی (معاصر نایب السلطنه و بازرگان معروف) ساخته شده و در ضلع شمالی حیاط مدرسه حاج صفر‌علی در قسمت یمنی دوز بازار قرار گرفته. مسجد حاج صفر‌علی ساختمونی بزرگ و زیبا و گنبید بلند داره همینطور مناره‌ای که با کاشی‌های آبی رنگ تزیین شده. یه نکته جالب در مورد مسجد اینکه، در قسمت شرقی و غربی مسجد، دو تالار ستون‌دار هست که هر کدومشون مسجدی جداگانه به حساب میاد. در فاصله‌ی بین مسجد اصلی و این دو تالار، پنجره¬های چوبی گذاشتن که وقتی باز میشن هر سه صحن مثل یه مسجد درمیاد. در قسمت‌های دیگه حیاط حجره‌هایی برای طلاب علوم دینی ساخته شده.