مسجد جامع نائین یکی از قدیمی‌ترین مسجدهای ایران به حساب میاد و زمان ساختش مشخص نیست. البته عده‌ای میگن که در دوره خلافت عمرابن عبدالعزیز ساخته شده. پروفسور پوپ ساختمون مسجد رو به سال 350 هـ.ق و آندره گدار فرانسوی اون رو به دوران حکومت دیلمیان مربوط می‌دونن. مسجد جامع نائین در محله قدیمی شهر نائین و نزدیک به خانه پیرنیا و نارین قلعه واقع شده. این مسجد زیبا شبستان‌های بزرگی شبیه به شبستان‌های چهل ستون داره که در سه طرف صحن قرار دارن. در گوشه شمال شرقی هم ایوانی سراسری با یک ردیف ستون ساخته شده بوده که تا قرن چهارم هـ . ق وجود داشته.

آجر کاری‌های زیبای اطراف صحن مسجد جامع نائین خیلی شبیه آجر کاری‌های سردر شمالی مسجد حکیم اصفهان هست و از اون جایی که اون مسجد مربوط به دوره دیلمیان می‌شده، میشه حدس زد که مسجد جامع نائین هم مربوط به همون دوره می‌شده. منبر مسجد نائین به منبر مسجد مدینه الرسول (ص) و منبر مسجد گوهرشاد شباهت زیادی داره. در گوشه جنوبی مسجد، مناره‌ای آجری به ارتفاع 28 متر وجود داره که بر خلاف مناره‌های دیگه، حالت استوانه‌ای نداره و حالت هشت ضلعی داره. برای اینکه از مسجد جامع نائین محافظت بشه سال 1310، اسم این مسجد با شماره 144در فهرست آثار ملی ایران به ثبت رسیده.